ブログ

Jan 02, 2024

SARS に対する唾液の精度

BMC 感染症第 23 巻、記事番号: 295 (2023) この記事を引用 905 アクセス 1 Altmetric メトリクスの詳細 一方、鼻咽頭 (NP) 綿棒は重症患者のゴールドスタンダードと考えられています。

BMC 感染症第 23 巻、記事番号: 295 (2023) この記事を引用

905 アクセス

1 オルトメトリック

メトリクスの詳細

鼻咽頭（NP）スワブは、重症急性呼吸器コロナウイルス 2（SARS-CoV-2）リアルタイム逆転写ポリメラーゼ連鎖反応（RT-PCR）検出のゴールドスタンダードと考えられていますが、唾液が代替検体であることがいくつかの研究で示されています。新型コロナウイルス感染症の診断とスクリーニングに。

オミクロン変異株の循環中に新型コロナウイルス感染症（COVID-19）を診断する際の唾液の有用性を分析するため、成人と小児におけるSARS-CoV-2感染の自然史を評価するために設計された進行中のコホートに参加者が登録された。 感度、特異度、陽性的中率 (PPV)、陰性的中率 (NPV)、およびコーエンのカッパ係数を計算して、診断性能を評価しました。

全体として、2022 年 1 月 3 日から 2 月 2 日までに 365 人の外来患者から 818 個のサンプルが収集されました。年齢中央値は 32.8 歳 (範囲: 3 ～ 94 歳) でした。 SARS-CoV-2のRT-PCRは、症状のある患者121人中97人（80.2％）、無症候性患者244人中62人（25.4％）で確認された。 唾液と鼻咽頭/中咽頭の混合サンプル間の実質的な一致は、コーエンのカッパ値 0.74 [95% 信頼区間 (CI): 0.67 ～ 0.81] で観察されました。 感度は77%（95% CI: 70.9-82.2）、特異度は95%（95% CI: 91.9-97）、PPV 89.8%（95% CI: 83.1-94.4）、NPV 87.9%（95% CI: 83.6-）でした。 91.5)、精度 88.5% (95% CI: 85.0-91.4)。 症状のある3歳以上の小児および青少年から採取したサンプルでは感度が高く[84% (95% CI: 70.5-92)]、コーエンのカッパ値は0.63 (95% CI: 0.35-0.91)でした。

唾液は、特にオミクロン変異体の循環中に症状のある小児や青少年にとって、SARS-CoV-2 を検出するための信頼できる液体です。

査読レポート

2021 年 11 月 26 日、世界保健機関 (WHO) は、ウイルス進化に関する WHO 技術諮問グループの助言に基づき、系統 B.1.1.529 をオミクロンという名前の懸念される変異体 (VOC) に指定しました [1]。 2022 年 1 月初め、ブラジルのリオデジャネイロでは、新型コロナウイルス感染症の感染者数が大幅に増加しました。 COVID-19 オズワルド・クルーズ財団 (Fiocruz) ゲノム監視ネットワークおよびその他の機関によって実施されたゲノム配列研究では、これらの症例の 96% は Omicron 変異株が原因であることが示唆されました (http://www.genomahcov.fiocruz.br/dashboard- en/) [2]。

鼻咽頭（NP）ぬぐい液は、SARS-CoV-2 リアルタイム逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応（RT-PCR）検出のゴールドスタンダードと考えられていますが、唾液が新型コロナウイルス感染症（COVID-19）の診断とスクリーニングの代替検体であることがいくつかの研究で示されています。 [3、4、5、6]、無症状者および外来患者を含む[7、8]。 唾液の採取は非侵襲的であり、綿棒よりも許容され、受け入れられやすい[7]。 その結果、医療従事者と患者との直接の接触が避けられるため、医療従事者の感染リスクが軽減され、個人用保護具の使用が減少します[9、10]。 イーら。 は、唾液と NP スワブの性能が症候性小児患者と無症候性小児患者で同等であることを観察しました [9]。 さらに、ある研究では、ペアの中鼻甲介スワブと比較して、唾液スワブにおける Omicron 変異体について 100% の肯定的な一致が示されました [11]。

われわれは、新型コロナウイルス感染症が疑われる外来患者とその家族接触者を対象に、よだれによる非刺激全唾液（UWS）の精度を、鼻咽頭と深部中咽頭（OP）ぬぐい液を組み合わせた場合と比較して報告する。 また、無症候性患者と症候性患者の UWS および NP/OP を組み合わせたサイクル閾値 (Ct) 値の分布も比較しました。

患者情報と臨床サンプルは、成人と小児における SARS-CoV-2 感染の自然経過を評価するために設計された公開前向きコホート研究から得られました。 初発症例と同じ住所に居住する接触者には、研究への登録が提案された。 研究期間中、無症候性および症状のある成人、青少年、および小児が、リオデジャネイロ都市圏にあるエヴァンドロ・シャーガス国立感染症研究所（INI）およびジェルマーノ・シンヴァル・ファリア保健センター[12]に集められた。 社会経済的特徴があまり好ましくない地域であるマンギーニョスのコミュニティの住民は、ジェルマーノ シンヴァル ファリア保健センターで募集されました。 一方、外来診療所 (INI) で募集された参加者は、リオデジャネイロ都市圏全域から集まりました。リオデジャネイロには、首都から遠く離れ、異なる社会人口学的プロフィールを持つ多くの自治体が含まれています。